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更新時(shí)間(jiān):2023-02-07
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使用(yòng)福爾(ěr)馬(mǎ)林固(gù)定(dìng)過組織,其(qí)組織(zhī)中的(dí)蛋(dàn)白質(zhì)與(yǔ)核酸(suān)(DNA與(yǔ)RNA)會(huì)失(shī)去(qù)生(shēng)物活性。福(fú)爾(ěr)馬林和石蠟作(zuò)為(wéi)固(gù)定(dìng)劑(jì)和(hé)包埋劑,將細胞保(bǎo)護在(zài)其(qí)中,十分影響(xiǎng)核酸(suān)的提取,並且(qiě)長(cháng)時間(jiān)的(dí)保存可(kě)能(néng)會使(shǐ)樣品中的(dí)核酸(suān)發生(shēng)降解。
傳統(tǒng)的方法(fǎ)會(huì)使(shǐ)用二(èr)甲苯(běn)來溶解(jiě)石(shí)蠟,這(zhè)種有(yǒu)機(jī)溶劑高度(dù)易(yì)燃(rán),在(zài)實驗過程中需要(yào)先(xiān)多次使用(yòng)二甲(jiǎ)苯來溶解石(shí)蠟,之後(hòu)需要多次使(shǐ)用乙(yǐ)醇來(lái)衝洗殘留(liú)的二甲(jiǎ)苯。在(zài)使用二甲苯(běn)溶解石蠟的(dí)過程(chéng)中(zhōng),大(dà)量的二甲(jiǎ)苯可(kě)能(néng)會對核酸造成(chéng)損傷(shāng),進(jìn)一步加(jiā)劇(jù)核酸(suān)的降(jiàng)解(jiě);在(zài)溶解與衝洗過程中,即使(shǐ)再仔(zī)細(xì)也難免(miǎn)將寶(bǎo)貴的組(zǔ)織材料衝(chōng)掉;並且衝洗(xǐ)過程(chéng)很難將二(èr)甲苯WAN全洗(xǐ)淨,殘(cán)留(liú)的二甲苯(běn)也(yě)會影(yǐng)響(xiǎng)核酸的提(tí)取(qǔ)效(xiào)果(guǒ)。
此外(wài),組(zǔ)織的(dí)消(xiāo)化(huà)程度(dù)也(yě)會影響DNA的(dí)提取(qǔ)效率(shuài),組織(zhī)不(bù)WAN全消化極(jí)大的(dí)影響(xiǎng)DNA的(dí)提(tí)取效(xiào)率。
總(zǒng)的來說(shuō),從FFPE組織中提(tí)取(qǔ)DNA受到(dào)以(yǐ)下幾個(gè)因素的製約:組織(zhī)材(cái)料有限且長時間(jiān)保(bǎo)存導致DNA受損,產(chǎn)量降(jiàng)低;使用(yòng)福爾(ěr)馬(mǎ)林浸(jìn)泡組(zǔ)織(zhī),導(dǎo)致(zhì)不可(kě)逆的DNA交(jiāo)聯,這(zhè)部(bù)分(fēn)DNA已(yǐ)無法(fǎ)進行擴(kuò)增(zēng)。
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit(貨(huò)號(hào)56404)技(jì)術(shù)原理(lǐ)
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit(貨(huò)號56404)可(kě)以成功(gōng)克服(fú)影響FFPRE DNA提取(qǔ)質(zhì)量的(dí)因(yīn)素,從而(ér)得到高質量DNA。
QIAamp DNA FFPE Tissue Kit使用成(chéng)熟(shú)的QIAamp MinElute技(jì)術(shù),從(cóng)小體(tǐ)積(jī)樣本(běn)中純化基因(yīn)組DNA和綫(xiàn)粒體DNA。該(gāi)試(shì)劑盒(hé)同(tóng)時具備矽(guī)膠(jiāo)膜選(xuǎn)擇(zé)性(xìng)結合DNA的特性,以及20 µl到(dào)100 µl的靈活(huó)洗脫(tuō)體(tǐ)積。
經專(zhuān)門(mén)優(yōu)化(huà)的裂解(jiě)條(tiáo)件,無(wú)需(xū)過夜溫育即可(kě)從福爾馬(mǎ)林(lín)固定,石(shí)蠟包埋組(zǔ)織中高(gāo)效純(chún)化(huà)基(jī)因組(zǔ)DNA。蛋白酶(méi)K消(xiāo)化後(hòu)在較(jiào)高的(dí)溫度溫育(yù),部分(fēn)去除(chú)遊離DNA的福(fú)爾馬(mǎ)林(lín)交聯,提高(gāo)DNA產量(liáng)和(hé)純(chún)度,更(gēng)適(shì)用於下遊應(yīng)用。需(xū)要注意(yì)的(dí)是,從福爾(ěr)馬(mǎ)林固定,石(shí)蠟包埋(mái)樣本中分(fēn)離(lí)的DNA分子(zǐ)量通常低(dī)於新鮮(xiān)或冷凍(dòng)樣(yàng)本中的DNA。DNA片段化(huà)的(dí)程(chéng)度取(qǔ)決於(yú)樣本類(lèi)型,儲存(cún)時(shí)間(jiān)以及(jí)固(gù)定的(dí)條件(jiàn)。
使(shǐ)用Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit(貨號(hào)56404)提(tí)取的高質量(liáng)DNA可以直接(jiē)應(yīng)用於(yú)多個下遊反應。如單核(hé)苷酸(suān)多(duō)態(tài)性(SNP),短(duǎn)串聯(lián)重(zhòng)復(fù)序列(STR)基因分型和藥(yào)物(wù)基(jī)因(yīn)組學(xué)研究,也可用於PCR。
Qiagen QIAamp DNA FFPE Tissue Kit(貨(huò)號(hào)56404)的優(yōu)點:
1. 流程簡(jiǎn)單
2.最快(kuài)僅30分鐘(zhōng)即(jí)可得(dé)到高(gāo)純(chún)DNA
3.特別適用(yòng)於同(tóng)時(shí)處理(lǐ)多個樣本。
4. 從小體(tǐ)積(jī)樣(yàng)本中純化基(jī)因組DNA和(hé)綫粒體DNA
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