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更新時(shí)間:2023-10-25
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你(nǐ)知(zhī)道什麼(mó)是你知道什(shí)麼是(shì)瓊脂(zhī)糖(táng)凝膠(jiāo)電泳嗎(má)?讓(ràng)我(wǒ)們一起(qǐ)來(lái)看看吧!
一,瓊脂(zhī)糖(táng)凝膠的特點
核(hé)酸(suān)分(fēn)子是兩性(xìng)解(jiě)離分子(zǐ),在(zài)高(gāo)於(yú)其等電(diàn)點(diǎn)的電泳緩衝液(yè)中(zhōng),其鹼基不解(jiě)離(lí),而(ér)磷(lín)酸(suān)基團全(quán)部解(jiě)離(lí),核酸分子(zǐ)因而(ér)帶負(fù)電荷(hé),電泳時向(xiàng)正極(jí)遷(qiān)移。
瓊脂糖主要(yào)從海洋(yáng)植物(wù)瓊(qióng)脂中(zhōng)提(tí)取而(ér)來並經(jīng)糖基(jī)化(huà)修(xiū)飾,為(wéi)一種(zhǒng)聚合鏈(liàn)綫(xiàn)性分(fēn)子(zǐ),使(shǐ)用瓊脂(zhī)糖(táng)凝(níng)膠作為電泳支持介質(zhì),發揮分(fēn)子篩(shāi)功(gōng)能,使(shǐ)得(dé)大小和(hé)構象不同(tóng)的核酸分子的(dí)遷(qiān)移率(shuài)出現(xiàn)較大差(chà)異,從而達(dá)到分離的目(mù)的。

因此(cǐ),目(mù)前多(duō)用瓊(qióng)脂糖為電(diàn)泳(yǒng)支持(chí)物進(jìn)行平(píng)板電泳(yǒng),其優點(diǎn)如(rú)下。
(1)瓊脂糖凝膠電泳操作(zuò)簡單,電泳(yǒng)速(sù)度(dù)快,樣品不需(xū)事先(xiān)處理(lǐ)就可以進行電(diàn)泳(yǒng)。
(2)瓊脂(zhī)糖凝膠結構均匀,含水(shuǐ)量大(dà)(約占 98%~99%),近似(sì)自由(yóu)電泳,樣品擴散較自由電流(liú),對(duì)樣品(pǐn)吸附(fù)極微, 因此電泳圖譜清(qīng)晰(xī),分辨率(shuài)高,重復性(xìng)好。
(3)瓊脂(zhī)糖透明無(wú)紫外吸收,電(diàn)泳(yǒng)過(guò)程和(hé)結(jié)果(guǒ)可直接用紫外(wài)光(guāng)燈檢測(cè)及定(dìng)量(liáng)測定(dìng)。
(4)電泳(yǒng)後區帶易染色,樣(yàng)品極易(yì)洗脫(tuō),便(biàn)於定(dìng)量(liáng)測定。製成幹膜(mó)可長期保存。
二,DNA 的(dí)瓊(qióng)脂糖凝(níng)膠電(diàn)泳
瓊脂糖凝膠電泳(yǒng)對核酸的(dí)分(fēn)離(lí)作(zuò)用主要是依據(jù)它(tā)們(mén)的相對分子(zǐ)量質量及分(fēn)子(zǐ)構(gòu)型(xíng),同(tóng)時(shí)與凝膠的(dí)濃度(dù)也有密切關(guān)係(xì)。
1. 核(hé)酸分子(zǐ)大小與瓊(qióng)脂糖濃(nóng)度的(dí)關係
(1)DNA分子的(dí)大小在(zài)凝膠(jiāo)中(zhōng),DNA 片(piàn)段(duàn)遷移距離(遷移率)與鹼基對(duì)的(dí)對數成反比,因此(cǐ)通過已知(zhī)大小的(dí)標(biāo)準(zhǔn)物移(yí)動(dòng)的(dí)距離與(yǔ)未(wèi)知(zhī)片(piàn)段的(dí)移(yí)動(dòng)距離時行比較(jiào),便可測出未(wèi)知(zhī)片(piàn)段的(dí)大小。
(2)瓊脂脂(zhī)糖(táng)的濃度 如下(xià)表所(suǒ)示,不(bù)同(tóng)大小的DNA需要(yào)用不(bù)同濃度的瓊(qióng)脂糖凝膠(jiāo)進(jìn)行電(diàn)泳分(fēn)離。
核(hé)酸構(gòu)型與瓊(qióng)脂糖(táng)凝膠(jiāo)電泳分離(lí)的關(guān)係(xì)
2. 同構型(xíng) DNA 的移動速度次序(xù)為:供價閉環(huán) DNA(covalently closed circular,cccDNA)>直(zhí)綫 DNA>開(kāi)環(huán) 的雙(shuāng)鏈環(huán)狀 DNA。
當瓊(qióng)脂(zhī)糖濃(nóng)度太高時,環狀 DNA不能(néng)進(jìn)入膠中,相對(duì)遷(qiān)移(yí)率(shuài)為(wéi) 0(Rm=0),而(ér)同等大小的(dí)直(zhí)綫雙(shuāng)鏈(liàn) DNA(剛性(xìng)棒狀(zhuàng))則可(kě)以(yǐ)長(cháng)軸(zhóu)方向前(qián)進(Rm>0),由此可(kě)見,這三種構(gòu)型的相對遷(qiān)移率主(zhǔ)要取決於凝膠(jiāo)濃(nóng)度,但(dàn)同時(shí),也受到電流強度,緩衝(chōng)液(yè)離子強度(dù)等的影(yǐng)響。
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