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讓(ràng)小編(biān)來(lái)詳細(xì)解析(xī)一(yī)下(xià)qPCR(實時熒光(guāng)定量(liáng)PCR)的(dí)原理(lǐ)。這是一(yī)項在分(fēn)子(zǐ)生物(wù)學,醫學診(zhěn)斷,生物(wù)技(jì)術(shù)等(děng)領域的核心技術。
一,qPCR的核(hé)心原理(lǐ):實(shí)時(shí)監(jiān)測與(yǔ)定量
簡單來說(shuō),qPCR是(shì)一(yī)種(zhǒng)在(zài)PCR(聚(jù)合酶鏈(liàn)式反應)擴增過(guò)程(chéng)中,通過(guò)熒光信號(hào)對(duì)DNA模板進行(háng)實時(shí)監(jiān)測和定(dìng)量(liáng)的技(jì)術(shù)。
它(tā)解決(jué)了(liǎo)傳統PCR隻(zhī)能(néng)進(jìn)行終點檢測(cè)(擴增(zēng)結(jié)束(shù)後通過(guò)電泳(yǒng)看(kàn)條帶)而無法精(jīng)確定(dìng)量(liáng)的問(wèn)題(tí)。
二(èr),兩種主流的信(xìn)號產生機製:
1. 非特異性(xìng)檢測:DNA結(jié)合(hé)染料法(如(rú)SYBR Green)
- 原理(lǐ):SYBR Green是一種能(néng)特(tè)異性(xìng)地嵌入雙鏈(liàn)DNA(dsDNA)小(xiǎo)溝中的(dí)熒光染料。當它與dsDNA結合後,熒光強度會(huì)顯著(zhù)增(zēng)強。
- 過(guò)程:在每(měi)輪PCR的延(yán)伸階(jiē)段,新(xīn)合成的雙(shuāng)鏈(liàn)DNA會結(jié)合染(rǎn)料(liào),並發(fā)出熒光。熒(yíng)光強(qiáng)度與(yǔ)反(fǎn)應體(tǐ)係(xì)中的雙(shuāng)鏈(liàn)DNA總(zǒng)量(liáng)成(chéng)正(zhèng)比。
- 優(yōu)點(diǎn):成(chéng)本(běn)低(dī),使用(yòng)方便,無需設計(jì)探針,適用於任何PCR擴增。
- 缺(quē)點:特異性較(jiào)低。染(rǎn)料(liào)會結(jié)合(hé)任何雙鏈(liàn)DNA,包(bāo)括非(fēi)特異性(xìng)擴增產物(wù)和引物二(èr)聚(jù)體,從(cóng)而產生假(jiǎ)陽性信號(hào)。因此必須(xū)通(tōng)過熔解曲(qū)綫分(fēn)析(xī)來(lái)驗證擴(kuò)增(zēng)產物(wù)的特(tè)異性(xìng)。
2. 特(tè)異(yì)性檢測:水(shuǐ)解(jiě)探(tàn)針(zhēn)法(如(rú)TaqMan探針)
- 原理:該技術使用一個序列(liè)特異(yì)性的寡核(hé)苷酸探(tàn)針。探針的5‘端帶(dài)有(yǒu)一個(gè)報(bào)告熒光基團,3’端帶(dài)有一(yī)個淬滅熒(yíng)光基團。
- 過程:
1. 當探針完(wán)整時,由於報(bào)告(gào)基(jī)團和(hé)淬滅基(jī)團距離很近,發(fā)生熒光共(gòng)振(zhèn)能(néng)量(liáng)轉移,報告(gào)基團(tuán)的熒(yíng)光被淬滅(miè)。
2. PCR擴增時(shí),當(dāng)引(yǐn)物(wù)退火(huǒ),探(tàn)針(zhēn)也會(huì)特(tè)異性地(dì)結合到模(mó)板上。
3. Taq酶(méi)在延伸(shēn)過(guò)程中,利用其5‘→3’外切(qiē)核酸酶(méi)活性(xìng)將探針(zhēn)水(shuǐ)解(jiě),使報告基(jī)團與淬(cuì)滅基(jī)團分離(lí)。
4. 報告基團(tuán)隨即發出熒(yíng)光(guāng)。
- 優(yōu)點:特(tè)異(yì)性ji高。隻有(yǒu)靶(bǎ)序(xù)列(liè)被(bèi)擴增時才會(huì)產(chǎn)生熒(yíng)光信號,有(yǒu)效(xiào)避(bì)免(miǎn)了非特異(yì)性(xìng)擴(kuò)增的幹(gān)擾(rǎo)。
- 缺(quē)點:成(chéng)本(běn)較高,需要(yào)為每(měi)個靶(bǎ)基因(yīn)精心(xīn)設計(jì)並合(hé)成(chéng)探針(zhēn)。
三(sān),如何定(dìng)量(liáng)?—— Ct值(zhí)的(dí)概念
qPCR定(dìng)量的(dí)關鍵在(zài)於(yú) Ct值(zhí)。
- 定(dìng)義:Ct值(zhí) 是指(zhǐ)每個(gè)反應(yīng)管(guǎn)內的熒(yíng)光(guāng)信(xìn)號達(dá)到設定(dìng)的(dí)閾值時所(suǒ)經歷(lì)的循環(huán)數。
- 意義:模板DNA的(dí)起始拷(kǎo)貝(bèi)數越多,達到(dào)熒光(guāng)閾(yù)值(zhí)所需的擴(kuò)增循環數就越(yuè)少(shǎo),即Ct值越小(xiǎo)。反(fǎn)之(zhī),起始(shǐ)拷(kǎo)貝數越少(shǎo),Ct值越(yuè)大。
- 定(dìng)量基礎:理論(lùn)上(shàng),PCR每個循環產物(wù)量翻(fān)倍(bèi)(指數(shù)增長期)。因此(cǐ),兩(liǎng)個樣品(pǐn)之間的Ct值(zhí)相(xiāng)差1,意味著起(qǐ)始模(mó)板(bǎn)量(liáng)相差(chà)約2倍。
通(tōng)過已知濃(nóng)度的(dí)標(biāo)準品繪製標準曲綫,就可以(yǐ)根(gēn)據未(wèi)知樣品的(dí)Ct值精(jīng)確計(jì)算出其起(qǐ)始(shǐ)模(mó)板量。定量方(fāng)法主(zhǔ)要有絕對定量和相(xiāng)對定(dìng)量(liáng)。
總結
qPCR技術(shù)憑(píng)借其(qí)高靈敏(mǐn)度(dù),高特異性(xìng),精確(què)定量和操作(zuò)便捷的特點(diǎn),已經(jīng)成(chéng)為現代生命科學研究(jiū)和分子診(zhěn)斷的基(jī)石(shí)技(jì)術。從(cóng)基(jī)礎科研(yán)的(dí)基因功能探(tàn)索,到臨床的(dí)疾病(bìng)診斷(duàn)與監控(kòng),再(zài)到(dào)食(shí)品(pǐn)安(ān)全檢測,其應用無處(chǔ)不在。理解其(qí)原理是正(zhèng)確進行(háng)實驗(yàn)設計和數據分(fēn)析的關(guān)鍵。
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一,輻(fú)射五(wǔ)大(dà)服(fú)務(wù)方(fāng)向(xiàng):
1.國(guó)內試劑(jì)耗材經銷代理(lǐ);
2.國(guó)外試劑(jì)訂購(直(zhí)訂,或(huò)境(jìng)外(wài)代理);
3.基因組測序(xù)(二(èr)代,二代+三(sān)代(dài));
4.基因分型(SNP檢(jiǎn)測):低/中/中(zhōng) 高(gāo)通量項目;
5.生物樣本運輸(國內(nèi),);
二(èr),多家代(dài)理品牌,涉(shè)及30多(duō)種,經(jīng)營代(dài)理500多(duō)個(gè)品牌:
Qiagen,Sigma,R&D,Epigentek,ThermoFisher,DNA Genotek,USA Scientific,
Matreya,Sage Science,List Labs,Macrocyclics,Steraloids,
NIBSC,mobio,immunodx,cellsystems,medicago,abcam
CST,Roche,Bethyl,sino Biological,clodrosome,adi
BIO-WORLD,TOKU-E,HYPHEN BioMed,moltox,ZeptoMetrix
International Humic,biocytex,Toxin Technology ,Streck
Elastin,biomax,Orflo Technologies,Accegen,Advbiomart,genlantis,coaChrom
ZYMO,Cygnus Technologies LLC,Enzyme Research,Bio/Data Corporation
Greer Lab ,Solarbio,bangslabs,bioline,musechem,Novocastra
stemrd,hyphen-biomed,polyplus,moltox ,exiqon,pentapharm,verichemlabs
GenStar,ALZET,lucernatechnologies ,meridian,origene,zimmerpeacocktech
horizondiscovery,Reagents,megazyme,elisasystems………
所(suǒ)有生物(wù)試劑耗材都(dū)可以(yǐ)進口,特別是冷門(mén)品(pǐn)牌(pái),均能給(gěi)客(kè)戶(hù)購買(mǎi)到。價格優,貨期(qī)短,可加急,較(jiào)快(kuài)10天(tiān)到貨;保(bǎo)證服務(wù)質(zhì)量,所有(yǒu)產品(pǐn)均(jūn)提(tí)供(gōng)售後服務。大部(bù)分(fēn)客(kè)戶我(wǒ)們(mén)提供(gōng)貨(huò)到(dào)付款(kuǎn)服(fú)務,

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